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检测DNA甲基化维持效率的方式研究获取新进展
时间:2021-03-22

我国科学院生物物理研究所研究员朱冰课题组在Nature Protocols上,在线发表了以Simultaneously measuring the methylation of parent and daughter strands of replicated DNA at the single-molecule level by Hammer-seq为题的研究论文。


在之前的工作中,朱冰课题组为研究复制叉过后DNA甲基化维持的动态过程与调控机制,开发了Hammer-seq。该方式结合了EdU标记新合成DNA链、点击化学反应在EdU位点添加biotin标签、Streptavidin亲和纯化和Hairpin全基因组DNA甲基化测序等技术,能够在DNA复制的不同时期,同时检测亲链和子链的DNA甲基化状态,进一步研究DNA甲基化的维持动态与调控机制。在Hammer-seq的开发过程中,此方式也在该课题组和清华大学教授颉伟课题组的一项合作工作中得到了应用。


检测DNA甲基化维持效率的方式研究获取新进展


为了拓展Hammer-seq的应用范围,科研人员详细描述了Hammer-seq的研发设计思路与优劣势等等,以及对Hammer-seq潜在的应用场景的美好展望,其中包括:解析复制叉过后新合成DNA链的甲基化维持速率;检测甲基化维持过程中伴随发生的从头甲基化事件;结合突变细胞系的构建,解析相应基因在调控甲基化动态维持过程的作用机制等。此外,简化版的Hammer-seq还可用来构建Hairpin全基因组DNA甲基化测序文库,相对于原来的方式来说,更加简便和易于操作。

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